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La restitution de copies numériques fidèles aux originaux en termes de réalisme passe par la capture de la forme et de l'apparence de ces objets. Nous avons proposé une méthode permettant d'automatiser certaines des étapes nécessaires à l'acquisition de ces deux informations. A gauche, une photographie de l'objet original. A droite: deux vues synthétisées à partir de la copie numérique de ce même objet.]] | La restitution de copies numériques fidèles aux originaux en termes de réalisme passe par la capture de la forme et de l'apparence de ces objets. Nous avons proposé une méthode permettant d'automatiser certaines des étapes nécessaires à l'acquisition de ces deux informations. A gauche, une photographie de l'objet original. A droite: deux vues synthétisées à partir de la copie numérique de ce même objet.]] | ||
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− | + | Le domaine de liaison du ligand du récepteur à la vitamine D est | |
+ | représentée dans sa structure filaire, un polygone transparent met en | ||
+ | évidence sa poche principale dans laquelle on peut distinguer un ligand | ||
+ | modélisé par une union de sphères.]] | ||
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− | Même protéine même poche, sans transparence. Les facettes vertes représentent un passage bloqué entre deux poches voisines.]] | + | Même protéine même poche, sans transparence cette fois. Les |
+ | facettes vertes représentent un passage bloqué entre deux poches | ||
+ | voisines. Cette information permettra par exemple au biologiste | ||
+ | d'étudier la possibilité de recruter cet espace vacant pour la synthèse | ||
+ | d'un autre ligand.]] | ||
==Thèse de Pierre Kraemer== | ==Thèse de Pierre Kraemer== |
Version du 4 juin 2007 à 09:02
Thèse de Marc fournier
Thèse de Frédéric Larue
Détection et caractérisation des poches dans les protéines (Benjamin Schwarz)
Étant donnée la structure d'une protéine, on recherche des cavités à l'aide d'algorithmes géométriques. Le formalisme géométrique permet une détection et une manipulation aisée des poches. On détermine par exemple les atomes participant de la périphérie de la poche, et donc susceptibles d'interagir avec un ligand. On peut en outre donner des valeurs de volume et d'aire de ces poches, utiles pour inférer la taille d'un ligand. La seconde partie du travail consistera à "habiller" les protéines et leurs poches à l'aide de patchs paramétriques pour donner une représentation lisse de leur surface.
Thèse de Pierre Kraemer
Thèse de Lucas Ammann
Jean-François Dufourd
Spécification des hypercartes, preuves du théorème du genre et de la formule d'Euler
Certification d'une opération de segmentation d'images 2D modélisées par des hypercartes colorées